Modelamiento, Docking y Dinámica Molecular de Proteína-Ligando

En este curso los particpantesa prenderán a construir, analizar y simular interacciones entre proteínas y ligandos utilizando metodologías computacionales avanzadas.

A lo largo del curso, se abordarán tres pilares fundamentales:

  • Modelamiento estructural: donde se explorará la predicción y optimización de estructuras de proteínas y ligando.

  • Docking molecular: para predecir la posición y conformación óptima de un ligando dentro de una diana molecular.

  • Dinámica molecular: para evaluar la estabilidad y flexibilidad de los complejos biomoleculares en condiciones fisiológicas.

Los participantes realizarán ejercicios prácticos con bases de datos reales, desarrollarán protocolos reproducibles y obtendrán habilidades para interpretar resultados en el contexto de la biología estructural y el diseño de fármacos.

07 Abril, 2025

30 horas

2 semanas

Tutoriales

Certificado

Evaluación

Online

Horario 17:00-20:00

Este curso es ideal para quienes desean incursionar en el modelado, docking y dinámica molecular y su aplicación en la investigación biomédica y farmacéutica

Modulo I: Modelamiento Molecular

  • Introducción al modelado molecular

  • Visualizadores de moléculas

  • Diseño de fármacos asistido por computadora

  • Introducción al diseño basado en el ligando

  • Identificación y elección del blanco molecular

  • Obtención de modelos de próteinas

  • Obtención de modelos de Ligando

Modulo II: Docking Molecular

  • Introducción al acoplamiento molecular

  • Docking molecular

  • Análisis de interacciones

  • Cribado virtual

Modulo II: Simulación de Dinámica Molecular

  • Introducción a la Simulación de Dinámica Molecular

  • Preparación de moléculas

  • Solvatación e Iones

  • Minimización de energía

  • Equilibración

  • Ejecutar simulación de dinámica molecular

  • Análisis de trayectoria simulación de dinámica molecular

  • Revisión de artículos científicos

  • Alcances y limitaciones de la simulación de Dinámica Molecular

  • Consideraciones Finales

Desarrolla tus habilidades

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Investigadores

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