Simulación de Dinámica Molecular

Alquimista Molecular ofrece servicios simulaciones de dinámica molecular, estas son técnicas computacionales que simulan el comportamiento de las moléculas a lo largo del tiempo. Al rastrear las posiciones y velocidades de los átomos individuales dentro de un sistema, se obtendran información sobre cómo estas moléculas interactúan, se pliegan y funcionan.

Ofrecemos los servicios de MDS de all-atoms, la cual es una técnica que permite estudiar el comportamiento de sistemas biológicos a nivel atómico a lo largo del tiempo. En este enfoque, cada átomo de las biomoléculas y su entorno (agua, iones, membranas) se modela explícitamente, permitiendo una descripción detallada de las interacciones moleculares.

• Precisión en la Representación Molecular: A diferencia de modelos simplificados (coarse-grained), este método captura interacciones atómicas específicas como enlaces de hidrógeno, fuerzas de van der Waals y efectos electrostáticos con alta resolución.

• Estudio de la Estabilidad y Dinámica Estructural: Permite analizar cómo cambian la conformación y flexibilidad de proteínas, ADN, ARN y complejos biomoleculares bajo diferentes condiciones.

• Diseño de Fármacos y Modelado de Interacciones: Es clave en la predicción del reconocimiento molecular entre proteínas y ligandos, ayudando a optimizar compuestos con potencial terapéutico.

• Condiciones Realistas: Se pueden simular ambientes celulares específicos (pH, temperatura, presión) para entender procesos biológicos en condiciones cercanas a la realidad.

• Análisis de Procesos Biológicos Dinámicos: Se usa para estudiar plegamiento de proteínas, mecanismos de resistencia a fármacos, transporte de moléculas y función enzimática.